Protein–RNA interactions for Protein: P00738

HP, Haptoglobin, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPP00738 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
HPP00738 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HPP00738 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
HPP00738 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
HPP00738 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
HPP00738 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
HPP00738 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
HPP00738 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HPP00738 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HPP00738 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HPP00738 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HPP00738 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HPP00738 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HPP00738 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HPP00738 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HPP00738 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HPP00738 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HPP00738 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HPP00738 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HPP00738 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HPP00738 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HPP00738 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
HPP00738 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HPP00738 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HPP00738 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HPP00738 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HPP00738 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HPP00738 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HPP00738 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HPP00738 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HPP00738 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HPP00738 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HPP00738 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HPP00738 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HPP00738 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HPP00738 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HPP00738 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HPP00738 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HPP00738 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HPP00738 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
HPP00738 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HPP00738 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HPP00738 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HPP00738 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HPP00738 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HPP00738 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HPP00738 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HPP00738 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HPP00738 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HPP00738 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HPP00738 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HPP00738 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HPP00738 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HPP00738 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HPP00738 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HPP00738 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HPP00738 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HPP00738 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HPP00738 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HPP00738 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HPP00738 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HPP00738 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HPP00738 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HPP00738 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HPP00738 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HPP00738 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HPP00738 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HPP00738 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HPP00738 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HPP00738 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HPP00738 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HPP00738 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HPP00738 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HPP00738 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HPP00738 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HPP00738 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HPP00738 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HPP00738 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HPP00738 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HPP00738 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HPP00738 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HPP00738 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HPP00738 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HPP00738 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HPP00738 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HPP00738 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HPP00738 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HPP00738 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HPP00738 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HPP00738 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HPP00738 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HPP00738 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HPP00738 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HPP00738 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HPP00738 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HPP00738 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HPP00738 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HPP00738 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HPP00738 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HPP00738 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms