Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
POLR1AO95602 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
POLR1AO95602 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
POLR1AO95602 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
POLR1AO95602 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
POLR1AO95602 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
POLR1AO95602 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
POLR1AO95602 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
POLR1AO95602 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
POLR1AO95602 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
POLR1AO95602 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
POLR1AO95602 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
POLR1AO95602 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
POLR1AO95602 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
POLR1AO95602 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
POLR1AO95602 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
POLR1AO95602 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
POLR1AO95602 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
POLR1AO95602 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
POLR1AO95602 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
POLR1AO95602 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.65
POLR1AO95602 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
POLR1AO95602 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
POLR1AO95602 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
POLR1AO95602 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
POLR1AO95602 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
POLR1AO95602 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
POLR1AO95602 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
POLR1AO95602 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
POLR1AO95602 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
POLR1AO95602 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
POLR1AO95602 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
POLR1AO95602 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
POLR1AO95602 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
POLR1AO95602 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
POLR1AO95602 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
POLR1AO95602 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
POLR1AO95602 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
POLR1AO95602 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
POLR1AO95602 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
POLR1AO95602 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
POLR1AO95602 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
POLR1AO95602 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
POLR1AO95602 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
POLR1AO95602 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
POLR1AO95602 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
POLR1AO95602 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
POLR1AO95602 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
POLR1AO95602 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
POLR1AO95602 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
POLR1AO95602 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
POLR1AO95602 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
POLR1AO95602 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
POLR1AO95602 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
POLR1AO95602 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
POLR1AO95602 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
POLR1AO95602 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
POLR1AO95602 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
POLR1AO95602 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
POLR1AO95602 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
POLR1AO95602 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
POLR1AO95602 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
POLR1AO95602 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
POLR1AO95602 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
POLR1AO95602 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
POLR1AO95602 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
POLR1AO95602 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
POLR1AO95602 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
POLR1AO95602 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
POLR1AO95602 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
POLR1AO95602 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
POLR1AO95602 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
POLR1AO95602 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
POLR1AO95602 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
POLR1AO95602 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
POLR1AO95602 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
POLR1AO95602 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
POLR1AO95602 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
POLR1AO95602 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
POLR1AO95602 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
POLR1AO95602 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
POLR1AO95602 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
POLR1AO95602 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
POLR1AO95602 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
POLR1AO95602 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
POLR1AO95602 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
POLR1AO95602 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
POLR1AO95602 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
POLR1AO95602 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
POLR1AO95602 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
POLR1AO95602 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
POLR1AO95602 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
POLR1AO95602 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
POLR1AO95602 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
POLR1AO95602 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
POLR1AO95602 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
POLR1AO95602 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
POLR1AO95602 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
POLR1AO95602 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
POLR1AO95602 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms