Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RASSF9O75901 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RASSF9O75901 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RASSF9O75901 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RASSF9O75901 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RASSF9O75901 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RASSF9O75901 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RASSF9O75901 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RASSF9O75901 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RASSF9O75901 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASSF9O75901 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASSF9O75901 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASSF9O75901 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASSF9O75901 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASSF9O75901 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASSF9O75901 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASSF9O75901 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASSF9O75901 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASSF9O75901 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASSF9O75901 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RASSF9O75901 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RASSF9O75901 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RASSF9O75901 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RASSF9O75901 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RASSF9O75901 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RASSF9O75901 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RASSF9O75901 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RASSF9O75901 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RASSF9O75901 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RASSF9O75901 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RASSF9O75901 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASSF9O75901 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASSF9O75901 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASSF9O75901 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASSF9O75901 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASSF9O75901 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RASSF9O75901 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RASSF9O75901 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RASSF9O75901 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RASSF9O75901 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RASSF9O75901 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RASSF9O75901 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RASSF9O75901 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RASSF9O75901 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RASSF9O75901 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASSF9O75901 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASSF9O75901 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASSF9O75901 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASSF9O75901 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASSF9O75901 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASSF9O75901 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASSF9O75901 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASSF9O75901 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASSF9O75901 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RASSF9O75901 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASSF9O75901 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 720.4 ms