Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC22BO75396 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEC22BO75396 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC22BO75396 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC22BO75396 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC22BO75396 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC22BO75396 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC22BO75396 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC22BO75396 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC22BO75396 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC22BO75396 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC22BO75396 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC22BO75396 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC22BO75396 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC22BO75396 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC22BO75396 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC22BO75396 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC22BO75396 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC22BO75396 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC22BO75396 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC22BO75396 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC22BO75396 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC22BO75396 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC22BO75396 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC22BO75396 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC22BO75396 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC22BO75396 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC22BO75396 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC22BO75396 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC22BO75396 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC22BO75396 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC22BO75396 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC22BO75396 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC22BO75396 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC22BO75396 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC22BO75396 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC22BO75396 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC22BO75396 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC22BO75396 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC22BO75396 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC22BO75396 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC22BO75396 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC22BO75396 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC22BO75396 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC22BO75396 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC22BO75396 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC22BO75396 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC22BO75396 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC22BO75396 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC22BO75396 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEC22BO75396 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC22BO75396 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms