Protein–RNA interactions for Protein: O60779

SLC19A2, Thiamine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A2O60779 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC19A2O60779 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC19A2O60779 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC19A2O60779 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC19A2O60779 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC19A2O60779 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC19A2O60779 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC19A2O60779 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC19A2O60779 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC19A2O60779 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC19A2O60779 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC19A2O60779 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC19A2O60779 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC19A2O60779 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC19A2O60779 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC19A2O60779 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC19A2O60779 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC19A2O60779 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC19A2O60779 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC19A2O60779 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC19A2O60779 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC19A2O60779 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC19A2O60779 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC19A2O60779 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC19A2O60779 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC19A2O60779 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC19A2O60779 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC19A2O60779 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC19A2O60779 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC19A2O60779 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms