Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGR3O43761 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGR3O43761 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNGR3O43761 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYNGR3O43761 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNGR3O43761 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNGR3O43761 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNGR3O43761 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNGR3O43761 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNGR3O43761 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNGR3O43761 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNGR3O43761 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNGR3O43761 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNGR3O43761 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNGR3O43761 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNGR3O43761 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNGR3O43761 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNGR3O43761 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNGR3O43761 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNGR3O43761 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNGR3O43761 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNGR3O43761 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNGR3O43761 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNGR3O43761 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNGR3O43761 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGR3O43761 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGR3O43761 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGR3O43761 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGR3O43761 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms