Protein–RNA interactions for Protein: O43747

AP1G1, AP-1 complex subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1G1O43747 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AP1G1O43747 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AP1G1O43747 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AP1G1O43747 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AP1G1O43747 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AP1G1O43747 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AP1G1O43747 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AP1G1O43747 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AP1G1O43747 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
AP1G1O43747 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AP1G1O43747 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AP1G1O43747 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AP1G1O43747 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AP1G1O43747 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AP1G1O43747 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AP1G1O43747 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AP1G1O43747 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AP1G1O43747 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AP1G1O43747 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AP1G1O43747 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AP1G1O43747 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AP1G1O43747 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AP1G1O43747 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AP1G1O43747 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AP1G1O43747 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AP1G1O43747 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
AP1G1O43747 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AP1G1O43747 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
AP1G1O43747 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AP1G1O43747 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AP1G1O43747 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AP1G1O43747 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AP1G1O43747 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AP1G1O43747 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
AP1G1O43747 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AP1G1O43747 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AP1G1O43747 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP1G1O43747 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AP1G1O43747 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP1G1O43747 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP1G1O43747 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AP1G1O43747 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AP1G1O43747 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
AP1G1O43747 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP1G1O43747 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AP1G1O43747 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AP1G1O43747 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AP1G1O43747 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AP1G1O43747 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP1G1O43747 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP1G1O43747 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP1G1O43747 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP1G1O43747 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AP1G1O43747 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP1G1O43747 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP1G1O43747 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP1G1O43747 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP1G1O43747 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP1G1O43747 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AP1G1O43747 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP1G1O43747 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
AP1G1O43747 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AP1G1O43747 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP1G1O43747 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP1G1O43747 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP1G1O43747 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP1G1O43747 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP1G1O43747 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP1G1O43747 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
AP1G1O43747 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP1G1O43747 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP1G1O43747 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms