Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
HTATSF1O43719 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HTATSF1O43719 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
HTATSF1O43719 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
HTATSF1O43719 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
HTATSF1O43719 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HTATSF1O43719 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
HTATSF1O43719 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
HTATSF1O43719 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
HTATSF1O43719 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
HTATSF1O43719 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
HTATSF1O43719 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
HTATSF1O43719 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
HTATSF1O43719 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
HTATSF1O43719 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
HTATSF1O43719 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
HTATSF1O43719 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
HTATSF1O43719 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
HTATSF1O43719 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
HTATSF1O43719 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
HTATSF1O43719 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HTATSF1O43719 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
HTATSF1O43719 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
HTATSF1O43719 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
HTATSF1O43719 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
HTATSF1O43719 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
HTATSF1O43719 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
HTATSF1O43719 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
HTATSF1O43719 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HTATSF1O43719 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
HTATSF1O43719 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
HTATSF1O43719 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
HTATSF1O43719 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
HTATSF1O43719 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
HTATSF1O43719 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
HTATSF1O43719 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
HTATSF1O43719 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
HTATSF1O43719 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
HTATSF1O43719 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HTATSF1O43719 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
HTATSF1O43719 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HTATSF1O43719 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
HTATSF1O43719 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HTATSF1O43719 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
HTATSF1O43719 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
HTATSF1O43719 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
HTATSF1O43719 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
HTATSF1O43719 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
HTATSF1O43719 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
HTATSF1O43719 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
HTATSF1O43719 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
HTATSF1O43719 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
HTATSF1O43719 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
HTATSF1O43719 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
HTATSF1O43719 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
HTATSF1O43719 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
HTATSF1O43719 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
HTATSF1O43719 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
HTATSF1O43719 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
HTATSF1O43719 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
HTATSF1O43719 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
HTATSF1O43719 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
HTATSF1O43719 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
HTATSF1O43719 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HTATSF1O43719 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HTATSF1O43719 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
HTATSF1O43719 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
HTATSF1O43719 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
HTATSF1O43719 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HTATSF1O43719 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HTATSF1O43719 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HTATSF1O43719 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HTATSF1O43719 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HTATSF1O43719 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HTATSF1O43719 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
HTATSF1O43719 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
HTATSF1O43719 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
HTATSF1O43719 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
HTATSF1O43719 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
HTATSF1O43719 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
HTATSF1O43719 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HTATSF1O43719 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HTATSF1O43719 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HTATSF1O43719 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
HTATSF1O43719 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HTATSF1O43719 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HTATSF1O43719 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HTATSF1O43719 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
HTATSF1O43719 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
HTATSF1O43719 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
HTATSF1O43719 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HTATSF1O43719 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HTATSF1O43719 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
HTATSF1O43719 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
HTATSF1O43719 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
HTATSF1O43719 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
HTATSF1O43719 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
HTATSF1O43719 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HTATSF1O43719 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HTATSF1O43719 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms