Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MAP3K13O43283 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MAP3K13O43283 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MAP3K13O43283 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MAP3K13O43283 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MAP3K13O43283 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MAP3K13O43283 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MAP3K13O43283 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MAP3K13O43283 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MAP3K13O43283 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MAP3K13O43283 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MAP3K13O43283 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MAP3K13O43283 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MAP3K13O43283 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MAP3K13O43283 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MAP3K13O43283 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MAP3K13O43283 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MAP3K13O43283 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MAP3K13O43283 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MAP3K13O43283 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MAP3K13O43283 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MAP3K13O43283 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MAP3K13O43283 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MAP3K13O43283 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MAP3K13O43283 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MAP3K13O43283 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MAP3K13O43283 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MAP3K13O43283 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MAP3K13O43283 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MAP3K13O43283 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MAP3K13O43283 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MAP3K13O43283 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MAP3K13O43283 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MAP3K13O43283 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MAP3K13O43283 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MAP3K13O43283 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MAP3K13O43283 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MAP3K13O43283 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MAP3K13O43283 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MAP3K13O43283 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MAP3K13O43283 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MAP3K13O43283 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MAP3K13O43283 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MAP3K13O43283 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MAP3K13O43283 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MAP3K13O43283 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MAP3K13O43283 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MAP3K13O43283 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MAP3K13O43283 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MAP3K13O43283 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MAP3K13O43283 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MAP3K13O43283 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MAP3K13O43283 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MAP3K13O43283 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MAP3K13O43283 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MAP3K13O43283 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MAP3K13O43283 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MAP3K13O43283 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MAP3K13O43283 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MAP3K13O43283 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MAP3K13O43283 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MAP3K13O43283 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MAP3K13O43283 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MAP3K13O43283 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MAP3K13O43283 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K13O43283 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K13O43283 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K13O43283 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K13O43283 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K13O43283 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MAP3K13O43283 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MAP3K13O43283 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MAP3K13O43283 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K13O43283 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K13O43283 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K13O43283 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K13O43283 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K13O43283 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MAP3K13O43283 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MAP3K13O43283 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MAP3K13O43283 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MAP3K13O43283 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MAP3K13O43283 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MAP3K13O43283 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAP3K13O43283 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAP3K13O43283 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAP3K13O43283 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MAP3K13O43283 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MAP3K13O43283 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MAP3K13O43283 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MAP3K13O43283 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MAP3K13O43283 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MAP3K13O43283 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MAP3K13O43283 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MAP3K13O43283 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MAP3K13O43283 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MAP3K13O43283 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MAP3K13O43283 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MAP3K13O43283 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MAP3K13O43283 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms