Protein–RNA interactions for Protein: O43159

RRP8, Ribosomal RNA-processing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP8O43159 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP8O43159 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP8O43159 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RRP8O43159 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP8O43159 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RRP8O43159 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP8O43159 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP8O43159 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP8O43159 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RRP8O43159 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RRP8O43159 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP8O43159 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP8O43159 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RRP8O43159 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP8O43159 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP8O43159 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP8O43159 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RRP8O43159 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP8O43159 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP8O43159 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RRP8O43159 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP8O43159 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP8O43159 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP8O43159 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RRP8O43159 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP8O43159 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP8O43159 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP8O43159 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP8O43159 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RRP8O43159 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP8O43159 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP8O43159 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RRP8O43159 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP8O43159 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RRP8O43159 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP8O43159 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RRP8O43159 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP8O43159 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP8O43159 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RRP8O43159 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP8O43159 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP8O43159 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP8O43159 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP8O43159 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP8O43159 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP8O43159 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP8O43159 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP8O43159 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP8O43159 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP8O43159 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP8O43159 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP8O43159 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP8O43159 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP8O43159 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP8O43159 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP8O43159 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP8O43159 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP8O43159 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP8O43159 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP8O43159 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RRP8O43159 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RRP8O43159 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP8O43159 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP8O43159 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP8O43159 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP8O43159 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP8O43159 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP8O43159 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP8O43159 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP8O43159 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP8O43159 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP8O43159 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP8O43159 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP8O43159 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP8O43159 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP8O43159 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RRP8O43159 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRP8O43159 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRP8O43159 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRP8O43159 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RRP8O43159 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP8O43159 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP8O43159 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RRP8O43159 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP8O43159 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP8O43159 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RRP8O43159 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RRP8O43159 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RRP8O43159 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RRP8O43159 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RRP8O43159 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRP8O43159 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRP8O43159 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RRP8O43159 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRP8O43159 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRP8O43159 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRP8O43159 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RRP8O43159 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RRP8O43159 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RRP8O43159 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms