Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
CROCC2H7BZ55 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CROCC2H7BZ55 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CROCC2H7BZ55 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CROCC2H7BZ55 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CROCC2H7BZ55 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CROCC2H7BZ55 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CROCC2H7BZ55 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CROCC2H7BZ55 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CROCC2H7BZ55 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CROCC2H7BZ55 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CROCC2H7BZ55 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CROCC2H7BZ55 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CROCC2H7BZ55 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CROCC2H7BZ55 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CROCC2H7BZ55 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CROCC2H7BZ55 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CROCC2H7BZ55 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CROCC2H7BZ55 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CROCC2H7BZ55 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CROCC2H7BZ55 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CROCC2H7BZ55 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms