Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms