Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C5orf58C9J3I9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C5orf58C9J3I9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C5orf58C9J3I9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C5orf58C9J3I9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C5orf58C9J3I9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C5orf58C9J3I9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C5orf58C9J3I9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf58C9J3I9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf58C9J3I9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf58C9J3I9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf58C9J3I9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf58C9J3I9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf58C9J3I9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf58C9J3I9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf58C9J3I9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf58C9J3I9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf58C9J3I9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf58C9J3I9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf58C9J3I9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf58C9J3I9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf58C9J3I9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf58C9J3I9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C5orf58C9J3I9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C5orf58C9J3I9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C5orf58C9J3I9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C5orf58C9J3I9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C5orf58C9J3I9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C5orf58C9J3I9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
C5orf58C9J3I9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C5orf58C9J3I9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C5orf58C9J3I9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C5orf58C9J3I9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C5orf58C9J3I9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C5orf58C9J3I9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
C5orf58C9J3I9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C5orf58C9J3I9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C5orf58C9J3I9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C5orf58C9J3I9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C5orf58C9J3I9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C5orf58C9J3I9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C5orf58C9J3I9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C5orf58C9J3I9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C5orf58C9J3I9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C5orf58C9J3I9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C5orf58C9J3I9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C5orf58C9J3I9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C5orf58C9J3I9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C5orf58C9J3I9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C5orf58C9J3I9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C5orf58C9J3I9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C5orf58C9J3I9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C5orf58C9J3I9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C5orf58C9J3I9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C5orf58C9J3I9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C5orf58C9J3I9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
C5orf58C9J3I9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C5orf58C9J3I9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C5orf58C9J3I9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C5orf58C9J3I9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C5orf58C9J3I9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C5orf58C9J3I9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C5orf58C9J3I9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C5orf58C9J3I9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C5orf58C9J3I9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C5orf58C9J3I9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C5orf58C9J3I9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C5orf58C9J3I9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C5orf58C9J3I9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C5orf58C9J3I9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C5orf58C9J3I9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms