Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HACD1B0YJ81 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HACD1B0YJ81 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HACD1B0YJ81 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HACD1B0YJ81 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HACD1B0YJ81 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HACD1B0YJ81 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HACD1B0YJ81 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HACD1B0YJ81 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HACD1B0YJ81 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HACD1B0YJ81 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HACD1B0YJ81 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HACD1B0YJ81 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HACD1B0YJ81 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HACD1B0YJ81 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HACD1B0YJ81 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HACD1B0YJ81 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HACD1B0YJ81 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HACD1B0YJ81 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HACD1B0YJ81 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HACD1B0YJ81 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HACD1B0YJ81 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HACD1B0YJ81 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HACD1B0YJ81 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HACD1B0YJ81 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HACD1B0YJ81 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HACD1B0YJ81 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HACD1B0YJ81 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HACD1B0YJ81 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HACD1B0YJ81 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HACD1B0YJ81 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HACD1B0YJ81 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HACD1B0YJ81 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HACD1B0YJ81 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HACD1B0YJ81 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HACD1B0YJ81 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HACD1B0YJ81 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HACD1B0YJ81 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HACD1B0YJ81 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HACD1B0YJ81 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HACD1B0YJ81 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HACD1B0YJ81 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HACD1B0YJ81 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HACD1B0YJ81 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HACD1B0YJ81 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HACD1B0YJ81 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HACD1B0YJ81 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HACD1B0YJ81 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HACD1B0YJ81 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HACD1B0YJ81 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HACD1B0YJ81 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HACD1B0YJ81 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HACD1B0YJ81 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HACD1B0YJ81 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HACD1B0YJ81 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HACD1B0YJ81 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HACD1B0YJ81 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HACD1B0YJ81 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HACD1B0YJ81 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HACD1B0YJ81 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HACD1B0YJ81 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HACD1B0YJ81 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HACD1B0YJ81 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HACD1B0YJ81 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HACD1B0YJ81 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HACD1B0YJ81 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HACD1B0YJ81 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HACD1B0YJ81 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HACD1B0YJ81 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HACD1B0YJ81 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HACD1B0YJ81 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HACD1B0YJ81 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HACD1B0YJ81 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HACD1B0YJ81 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HACD1B0YJ81 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HACD1B0YJ81 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HACD1B0YJ81 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms