Protein–RNA interactions for Protein: A6NIE6

RRN3P2, Putative RRN3-like protein RRN3P2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P2A6NIE6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRN3P2A6NIE6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRN3P2A6NIE6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRN3P2A6NIE6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRN3P2A6NIE6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRN3P2A6NIE6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRN3P2A6NIE6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRN3P2A6NIE6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRN3P2A6NIE6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRN3P2A6NIE6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRN3P2A6NIE6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRN3P2A6NIE6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RRN3P2A6NIE6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRN3P2A6NIE6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRN3P2A6NIE6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRN3P2A6NIE6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRN3P2A6NIE6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRN3P2A6NIE6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRN3P2A6NIE6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RRN3P2A6NIE6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRN3P2A6NIE6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRN3P2A6NIE6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RRN3P2A6NIE6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRN3P2A6NIE6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRN3P2A6NIE6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRN3P2A6NIE6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRN3P2A6NIE6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRN3P2A6NIE6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRN3P2A6NIE6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRN3P2A6NIE6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRN3P2A6NIE6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRN3P2A6NIE6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRN3P2A6NIE6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRN3P2A6NIE6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRN3P2A6NIE6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRN3P2A6NIE6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRN3P2A6NIE6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRN3P2A6NIE6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RRN3P2A6NIE6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRN3P2A6NIE6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRN3P2A6NIE6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms