Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMX3A6NHT5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMX3A6NHT5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMX3A6NHT5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HMX3A6NHT5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMX3A6NHT5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HMX3A6NHT5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMX3A6NHT5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMX3A6NHT5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMX3A6NHT5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMX3A6NHT5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HMX3A6NHT5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMX3A6NHT5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HMX3A6NHT5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HMX3A6NHT5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HMX3A6NHT5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMX3A6NHT5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMX3A6NHT5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMX3A6NHT5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMX3A6NHT5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMX3A6NHT5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMX3A6NHT5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMX3A6NHT5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMX3A6NHT5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMX3A6NHT5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMX3A6NHT5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HMX3A6NHT5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMX3A6NHT5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMX3A6NHT5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMX3A6NHT5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMX3A6NHT5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMX3A6NHT5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMX3A6NHT5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMX3A6NHT5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HMX3A6NHT5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMX3A6NHT5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HMX3A6NHT5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms