Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRD1A4D1F6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms