Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRD1A4D1F6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRD1A4D1F6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRD1A4D1F6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRD1A4D1F6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRD1A4D1F6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRD1A4D1F6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms