Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VWA8A3KMH1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VWA8A3KMH1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWA8A3KMH1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
VWA8A3KMH1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWA8A3KMH1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWA8A3KMH1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VWA8A3KMH1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VWA8A3KMH1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VWA8A3KMH1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VWA8A3KMH1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VWA8A3KMH1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VWA8A3KMH1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VWA8A3KMH1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VWA8A3KMH1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VWA8A3KMH1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VWA8A3KMH1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VWA8A3KMH1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VWA8A3KMH1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VWA8A3KMH1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VWA8A3KMH1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VWA8A3KMH1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
VWA8A3KMH1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
VWA8A3KMH1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VWA8A3KMH1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VWA8A3KMH1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VWA8A3KMH1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VWA8A3KMH1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VWA8A3KMH1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VWA8A3KMH1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VWA8A3KMH1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
VWA8A3KMH1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VWA8A3KMH1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VWA8A3KMH1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VWA8A3KMH1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VWA8A3KMH1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VWA8A3KMH1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VWA8A3KMH1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VWA8A3KMH1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VWA8A3KMH1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VWA8A3KMH1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VWA8A3KMH1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VWA8A3KMH1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VWA8A3KMH1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VWA8A3KMH1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VWA8A3KMH1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VWA8A3KMH1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VWA8A3KMH1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
VWA8A3KMH1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWA8A3KMH1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWA8A3KMH1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWA8A3KMH1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VWA8A3KMH1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWA8A3KMH1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
VWA8A3KMH1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWA8A3KMH1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VWA8A3KMH1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
VWA8A3KMH1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VWA8A3KMH1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VWA8A3KMH1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VWA8A3KMH1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VWA8A3KMH1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VWA8A3KMH1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VWA8A3KMH1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VWA8A3KMH1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VWA8A3KMH1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VWA8A3KMH1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VWA8A3KMH1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VWA8A3KMH1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VWA8A3KMH1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VWA8A3KMH1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VWA8A3KMH1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VWA8A3KMH1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VWA8A3KMH1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VWA8A3KMH1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VWA8A3KMH1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VWA8A3KMH1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VWA8A3KMH1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VWA8A3KMH1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms