Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A0A0U1RRA0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
A0A0U1RRA0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
A0A0U1RRA0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms