Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
CAMTA1Q9Y6Y1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CAMTA1Q9Y6Y1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CAMTA1Q9Y6Y1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CAMTA1Q9Y6Y1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CAMTA1Q9Y6Y1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CAMTA1Q9Y6Y1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CAMTA1Q9Y6Y1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CAMTA1Q9Y6Y1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CAMTA1Q9Y6Y1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CAMTA1Q9Y6Y1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CAMTA1Q9Y6Y1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CAMTA1Q9Y6Y1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CAMTA1Q9Y6Y1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CAMTA1Q9Y6Y1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CAMTA1Q9Y6Y1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CAMTA1Q9Y6Y1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CAMTA1Q9Y6Y1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CAMTA1Q9Y6Y1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CAMTA1Q9Y6Y1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CAMTA1Q9Y6Y1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CAMTA1Q9Y6Y1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CAMTA1Q9Y6Y1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CAMTA1Q9Y6Y1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CAMTA1Q9Y6Y1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CAMTA1Q9Y6Y1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CAMTA1Q9Y6Y1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CAMTA1Q9Y6Y1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CAMTA1Q9Y6Y1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CAMTA1Q9Y6Y1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CAMTA1Q9Y6Y1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
CAMTA1Q9Y6Y1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CAMTA1Q9Y6Y1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CAMTA1Q9Y6Y1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CAMTA1Q9Y6Y1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CAMTA1Q9Y6Y1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CAMTA1Q9Y6Y1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CAMTA1Q9Y6Y1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CAMTA1Q9Y6Y1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CAMTA1Q9Y6Y1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CAMTA1Q9Y6Y1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CAMTA1Q9Y6Y1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CAMTA1Q9Y6Y1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CAMTA1Q9Y6Y1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CAMTA1Q9Y6Y1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CAMTA1Q9Y6Y1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CAMTA1Q9Y6Y1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CAMTA1Q9Y6Y1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CAMTA1Q9Y6Y1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CAMTA1Q9Y6Y1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CAMTA1Q9Y6Y1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
CAMTA1Q9Y6Y1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CAMTA1Q9Y6Y1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CAMTA1Q9Y6Y1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CAMTA1Q9Y6Y1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
CAMTA1Q9Y6Y1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
CAMTA1Q9Y6Y1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CAMTA1Q9Y6Y1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CAMTA1Q9Y6Y1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CAMTA1Q9Y6Y1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CAMTA1Q9Y6Y1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CAMTA1Q9Y6Y1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CAMTA1Q9Y6Y1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CAMTA1Q9Y6Y1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35■■■■□ 3.19
CAMTA1Q9Y6Y1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CAMTA1Q9Y6Y1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CAMTA1Q9Y6Y1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CAMTA1Q9Y6Y1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CAMTA1Q9Y6Y1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CAMTA1Q9Y6Y1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CAMTA1Q9Y6Y1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CAMTA1Q9Y6Y1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CAMTA1Q9Y6Y1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CAMTA1Q9Y6Y1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CAMTA1Q9Y6Y1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CAMTA1Q9Y6Y1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CAMTA1Q9Y6Y1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CAMTA1Q9Y6Y1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CAMTA1Q9Y6Y1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CAMTA1Q9Y6Y1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CAMTA1Q9Y6Y1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CAMTA1Q9Y6Y1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CAMTA1Q9Y6Y1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CAMTA1Q9Y6Y1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CAMTA1Q9Y6Y1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CAMTA1Q9Y6Y1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CAMTA1Q9Y6Y1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CAMTA1Q9Y6Y1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CAMTA1Q9Y6Y1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms