Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G5

PCDHGA8, Protocadherin gamma-A8, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA8Q9Y5G5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHGA8Q9Y5G5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHGA8Q9Y5G5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHGA8Q9Y5G5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCDHGA8Q9Y5G5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHGA8Q9Y5G5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHGA8Q9Y5G5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHGA8Q9Y5G5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCDHGA8Q9Y5G5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCDHGA8Q9Y5G5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHGA8Q9Y5G5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHGA8Q9Y5G5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHGA8Q9Y5G5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHGA8Q9Y5G5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHGA8Q9Y5G5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCDHGA8Q9Y5G5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHGA8Q9Y5G5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCDHGA8Q9Y5G5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHGA8Q9Y5G5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHGA8Q9Y5G5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCDHGA8Q9Y5G5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHGA8Q9Y5G5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHGA8Q9Y5G5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCDHGA8Q9Y5G5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHGA8Q9Y5G5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCDHGA8Q9Y5G5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHGA8Q9Y5G5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHGA8Q9Y5G5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCDHGA8Q9Y5G5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHGA8Q9Y5G5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHGA8Q9Y5G5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHGA8Q9Y5G5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHGA8Q9Y5G5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHGA8Q9Y5G5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHGA8Q9Y5G5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHGA8Q9Y5G5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHGA8Q9Y5G5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHGA8Q9Y5G5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHGA8Q9Y5G5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHGA8Q9Y5G5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHGA8Q9Y5G5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHGA8Q9Y5G5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHGA8Q9Y5G5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHGA8Q9Y5G5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHGA8Q9Y5G5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHGA8Q9Y5G5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHGA8Q9Y5G5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHGA8Q9Y5G5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHGA8Q9Y5G5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHGA8Q9Y5G5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHGA8Q9Y5G5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHGA8Q9Y5G5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHGA8Q9Y5G5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHGA8Q9Y5G5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHGA8Q9Y5G5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHGA8Q9Y5G5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHGA8Q9Y5G5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHGA8Q9Y5G5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHGA8Q9Y5G5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHGA8Q9Y5G5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHGA8Q9Y5G5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHGA8Q9Y5G5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHGA8Q9Y5G5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHGA8Q9Y5G5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHGA8Q9Y5G5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHGA8Q9Y5G5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHGA8Q9Y5G5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHGA8Q9Y5G5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHGA8Q9Y5G5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHGA8Q9Y5G5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHGA8Q9Y5G5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCDHGA8Q9Y5G5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHGA8Q9Y5G5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHGA8Q9Y5G5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHGA8Q9Y5G5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHGA8Q9Y5G5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHGA8Q9Y5G5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHGA8Q9Y5G5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHGA8Q9Y5G5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHGA8Q9Y5G5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHGA8Q9Y5G5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHGA8Q9Y5G5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHGA8Q9Y5G5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHGA8Q9Y5G5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHGA8Q9Y5G5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHGA8Q9Y5G5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHGA8Q9Y5G5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHGA8Q9Y5G5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHGA8Q9Y5G5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHGA8Q9Y5G5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHGA8Q9Y5G5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHGA8Q9Y5G5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHGA8Q9Y5G5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHGA8Q9Y5G5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHGA8Q9Y5G5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHGA8Q9Y5G5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHGA8Q9Y5G5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHGA8Q9Y5G5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHGA8Q9Y5G5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHGA8Q9Y5G5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms