Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms