Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU5

USP24, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24, humanhuman

Predictions only

Length 2,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP24Q9UPU5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP24Q9UPU5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP24Q9UPU5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP24Q9UPU5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP24Q9UPU5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP24Q9UPU5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP24Q9UPU5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP24Q9UPU5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP24Q9UPU5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP24Q9UPU5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP24Q9UPU5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP24Q9UPU5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP24Q9UPU5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP24Q9UPU5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP24Q9UPU5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP24Q9UPU5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP24Q9UPU5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP24Q9UPU5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP24Q9UPU5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP24Q9UPU5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP24Q9UPU5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP24Q9UPU5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP24Q9UPU5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP24Q9UPU5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP24Q9UPU5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP24Q9UPU5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP24Q9UPU5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP24Q9UPU5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP24Q9UPU5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP24Q9UPU5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP24Q9UPU5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP24Q9UPU5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP24Q9UPU5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP24Q9UPU5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP24Q9UPU5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP24Q9UPU5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP24Q9UPU5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP24Q9UPU5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP24Q9UPU5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP24Q9UPU5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP24Q9UPU5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP24Q9UPU5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP24Q9UPU5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP24Q9UPU5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP24Q9UPU5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP24Q9UPU5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP24Q9UPU5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP24Q9UPU5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP24Q9UPU5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP24Q9UPU5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP24Q9UPU5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP24Q9UPU5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP24Q9UPU5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP24Q9UPU5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP24Q9UPU5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP24Q9UPU5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP24Q9UPU5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP24Q9UPU5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP24Q9UPU5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP24Q9UPU5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP24Q9UPU5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
USP24Q9UPU5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP24Q9UPU5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP24Q9UPU5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP24Q9UPU5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP24Q9UPU5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP24Q9UPU5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP24Q9UPU5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP24Q9UPU5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP24Q9UPU5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP24Q9UPU5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP24Q9UPU5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP24Q9UPU5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP24Q9UPU5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP24Q9UPU5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP24Q9UPU5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP24Q9UPU5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP24Q9UPU5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP24Q9UPU5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP24Q9UPU5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP24Q9UPU5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP24Q9UPU5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP24Q9UPU5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP24Q9UPU5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP24Q9UPU5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP24Q9UPU5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP24Q9UPU5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP24Q9UPU5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP24Q9UPU5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP24Q9UPU5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP24Q9UPU5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP24Q9UPU5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP24Q9UPU5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP24Q9UPU5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP24Q9UPU5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP24Q9UPU5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP24Q9UPU5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP24Q9UPU5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP24Q9UPU5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP24Q9UPU5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.5 ms