Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU5

USP24, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24, humanhuman

Predictions only

Length 2,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP24Q9UPU5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
USP24Q9UPU5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
USP24Q9UPU5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
USP24Q9UPU5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP24Q9UPU5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
USP24Q9UPU5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
USP24Q9UPU5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
USP24Q9UPU5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
USP24Q9UPU5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
USP24Q9UPU5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
USP24Q9UPU5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
USP24Q9UPU5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
USP24Q9UPU5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
USP24Q9UPU5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
USP24Q9UPU5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
USP24Q9UPU5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
USP24Q9UPU5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
USP24Q9UPU5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
USP24Q9UPU5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
USP24Q9UPU5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
USP24Q9UPU5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
USP24Q9UPU5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
USP24Q9UPU5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP24Q9UPU5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP24Q9UPU5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP24Q9UPU5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP24Q9UPU5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP24Q9UPU5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP24Q9UPU5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
USP24Q9UPU5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
USP24Q9UPU5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
USP24Q9UPU5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP24Q9UPU5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP24Q9UPU5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
USP24Q9UPU5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP24Q9UPU5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP24Q9UPU5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP24Q9UPU5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
USP24Q9UPU5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
USP24Q9UPU5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
USP24Q9UPU5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
USP24Q9UPU5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
USP24Q9UPU5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
USP24Q9UPU5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
USP24Q9UPU5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
USP24Q9UPU5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
USP24Q9UPU5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP24Q9UPU5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP24Q9UPU5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP24Q9UPU5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP24Q9UPU5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP24Q9UPU5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP24Q9UPU5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP24Q9UPU5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP24Q9UPU5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP24Q9UPU5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP24Q9UPU5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP24Q9UPU5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP24Q9UPU5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP24Q9UPU5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP24Q9UPU5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP24Q9UPU5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP24Q9UPU5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP24Q9UPU5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP24Q9UPU5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
USP24Q9UPU5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP24Q9UPU5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP24Q9UPU5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP24Q9UPU5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP24Q9UPU5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP24Q9UPU5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP24Q9UPU5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP24Q9UPU5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP24Q9UPU5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USP24Q9UPU5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP24Q9UPU5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP24Q9UPU5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP24Q9UPU5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP24Q9UPU5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP24Q9UPU5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
USP24Q9UPU5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP24Q9UPU5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP24Q9UPU5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP24Q9UPU5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
USP24Q9UPU5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
USP24Q9UPU5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP24Q9UPU5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
USP24Q9UPU5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP24Q9UPU5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP24Q9UPU5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP24Q9UPU5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP24Q9UPU5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP24Q9UPU5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP24Q9UPU5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP24Q9UPU5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP24Q9UPU5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
USP24Q9UPU5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
USP24Q9UPU5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP24Q9UPU5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP24Q9UPU5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms