Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACSL6Q9UKU0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACSL6Q9UKU0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACSL6Q9UKU0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACSL6Q9UKU0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACSL6Q9UKU0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACSL6Q9UKU0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACSL6Q9UKU0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACSL6Q9UKU0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACSL6Q9UKU0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACSL6Q9UKU0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACSL6Q9UKU0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACSL6Q9UKU0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACSL6Q9UKU0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACSL6Q9UKU0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACSL6Q9UKU0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACSL6Q9UKU0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACSL6Q9UKU0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACSL6Q9UKU0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACSL6Q9UKU0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSL6Q9UKU0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSL6Q9UKU0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSL6Q9UKU0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSL6Q9UKU0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSL6Q9UKU0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSL6Q9UKU0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSL6Q9UKU0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACSL6Q9UKU0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSL6Q9UKU0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSL6Q9UKU0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSL6Q9UKU0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACSL6Q9UKU0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACSL6Q9UKU0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACSL6Q9UKU0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACSL6Q9UKU0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSL6Q9UKU0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSL6Q9UKU0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSL6Q9UKU0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSL6Q9UKU0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACSL6Q9UKU0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACSL6Q9UKU0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACSL6Q9UKU0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACSL6Q9UKU0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSL6Q9UKU0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSL6Q9UKU0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSL6Q9UKU0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSL6Q9UKU0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSL6Q9UKU0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSL6Q9UKU0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSL6Q9UKU0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACSL6Q9UKU0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACSL6Q9UKU0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACSL6Q9UKU0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACSL6Q9UKU0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACSL6Q9UKU0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSL6Q9UKU0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSL6Q9UKU0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSL6Q9UKU0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSL6Q9UKU0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSL6Q9UKU0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSL6Q9UKU0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSL6Q9UKU0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACSL6Q9UKU0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACSL6Q9UKU0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACSL6Q9UKU0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ACSL6Q9UKU0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACSL6Q9UKU0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACSL6Q9UKU0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACSL6Q9UKU0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACSL6Q9UKU0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms