Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL13Q9P2N7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL13Q9P2N7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL13Q9P2N7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL13Q9P2N7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL13Q9P2N7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL13Q9P2N7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL13Q9P2N7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL13Q9P2N7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL13Q9P2N7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL13Q9P2N7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL13Q9P2N7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL13Q9P2N7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL13Q9P2N7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL13Q9P2N7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL13Q9P2N7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL13Q9P2N7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL13Q9P2N7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL13Q9P2N7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL13Q9P2N7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL13Q9P2N7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL13Q9P2N7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL13Q9P2N7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL13Q9P2N7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL13Q9P2N7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL13Q9P2N7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL13Q9P2N7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL13Q9P2N7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL13Q9P2N7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL13Q9P2N7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL13Q9P2N7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL13Q9P2N7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL13Q9P2N7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL13Q9P2N7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL13Q9P2N7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL13Q9P2N7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL13Q9P2N7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL13Q9P2N7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL13Q9P2N7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL13Q9P2N7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL13Q9P2N7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL13Q9P2N7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL13Q9P2N7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL13Q9P2N7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL13Q9P2N7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL13Q9P2N7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL13Q9P2N7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL13Q9P2N7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL13Q9P2N7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL13Q9P2N7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL13Q9P2N7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL13Q9P2N7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL13Q9P2N7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL13Q9P2N7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL13Q9P2N7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL13Q9P2N7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL13Q9P2N7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL13Q9P2N7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL13Q9P2N7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL13Q9P2N7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL13Q9P2N7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL13Q9P2N7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL13Q9P2N7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL13Q9P2N7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL13Q9P2N7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL13Q9P2N7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL13Q9P2N7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL13Q9P2N7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL13Q9P2N7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms