Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL42Q9P2K6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL42Q9P2K6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL42Q9P2K6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL42Q9P2K6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL42Q9P2K6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL42Q9P2K6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL42Q9P2K6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL42Q9P2K6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL42Q9P2K6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL42Q9P2K6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL42Q9P2K6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL42Q9P2K6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KLHL42Q9P2K6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL42Q9P2K6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL42Q9P2K6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL42Q9P2K6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KLHL42Q9P2K6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL42Q9P2K6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL42Q9P2K6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL42Q9P2K6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL42Q9P2K6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL42Q9P2K6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL42Q9P2K6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL42Q9P2K6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL42Q9P2K6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL42Q9P2K6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL42Q9P2K6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL42Q9P2K6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL42Q9P2K6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL42Q9P2K6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL42Q9P2K6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL42Q9P2K6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL42Q9P2K6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL42Q9P2K6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL42Q9P2K6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL42Q9P2K6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL42Q9P2K6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL42Q9P2K6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL42Q9P2K6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL42Q9P2K6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL42Q9P2K6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL42Q9P2K6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL42Q9P2K6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL42Q9P2K6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL42Q9P2K6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL42Q9P2K6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL42Q9P2K6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL42Q9P2K6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL42Q9P2K6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL42Q9P2K6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL42Q9P2K6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL42Q9P2K6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL42Q9P2K6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL42Q9P2K6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KLHL42Q9P2K6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL42Q9P2K6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL42Q9P2K6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL42Q9P2K6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL42Q9P2K6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL42Q9P2K6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL42Q9P2K6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL42Q9P2K6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL42Q9P2K6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL42Q9P2K6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL42Q9P2K6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL42Q9P2K6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL42Q9P2K6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL42Q9P2K6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL42Q9P2K6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL42Q9P2K6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL42Q9P2K6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL42Q9P2K6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL42Q9P2K6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL42Q9P2K6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL42Q9P2K6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL42Q9P2K6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL42Q9P2K6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL42Q9P2K6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms