Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHD7Q9P2D1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHD7Q9P2D1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CHD7Q9P2D1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHD7Q9P2D1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHD7Q9P2D1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHD7Q9P2D1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHD7Q9P2D1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHD7Q9P2D1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHD7Q9P2D1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHD7Q9P2D1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHD7Q9P2D1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHD7Q9P2D1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHD7Q9P2D1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CHD7Q9P2D1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CHD7Q9P2D1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHD7Q9P2D1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHD7Q9P2D1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHD7Q9P2D1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHD7Q9P2D1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHD7Q9P2D1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHD7Q9P2D1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHD7Q9P2D1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHD7Q9P2D1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHD7Q9P2D1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHD7Q9P2D1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHD7Q9P2D1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHD7Q9P2D1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHD7Q9P2D1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHD7Q9P2D1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
CHD7Q9P2D1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHD7Q9P2D1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHD7Q9P2D1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHD7Q9P2D1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHD7Q9P2D1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHD7Q9P2D1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CHD7Q9P2D1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CHD7Q9P2D1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHD7Q9P2D1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CHD7Q9P2D1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHD7Q9P2D1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHD7Q9P2D1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHD7Q9P2D1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHD7Q9P2D1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHD7Q9P2D1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHD7Q9P2D1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHD7Q9P2D1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CHD7Q9P2D1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHD7Q9P2D1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHD7Q9P2D1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHD7Q9P2D1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHD7Q9P2D1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHD7Q9P2D1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHD7Q9P2D1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHD7Q9P2D1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHD7Q9P2D1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHD7Q9P2D1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHD7Q9P2D1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHD7Q9P2D1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHD7Q9P2D1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CHD7Q9P2D1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHD7Q9P2D1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHD7Q9P2D1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHD7Q9P2D1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHD7Q9P2D1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHD7Q9P2D1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHD7Q9P2D1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHD7Q9P2D1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHD7Q9P2D1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHD7Q9P2D1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHD7Q9P2D1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHD7Q9P2D1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHD7Q9P2D1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHD7Q9P2D1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHD7Q9P2D1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CHD7Q9P2D1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHD7Q9P2D1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHD7Q9P2D1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHD7Q9P2D1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHD7Q9P2D1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHD7Q9P2D1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHD7Q9P2D1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHD7Q9P2D1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHD7Q9P2D1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHD7Q9P2D1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CHD7Q9P2D1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHD7Q9P2D1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHD7Q9P2D1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHD7Q9P2D1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CHD7Q9P2D1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHD7Q9P2D1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHD7Q9P2D1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHD7Q9P2D1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHD7Q9P2D1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHD7Q9P2D1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHD7Q9P2D1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHD7Q9P2D1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHD7Q9P2D1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHD7Q9P2D1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHD7Q9P2D1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms