Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM6

PKD2L2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L2Q9NZM6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PKD2L2Q9NZM6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PKD2L2Q9NZM6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PKD2L2Q9NZM6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKD2L2Q9NZM6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKD2L2Q9NZM6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKD2L2Q9NZM6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKD2L2Q9NZM6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PKD2L2Q9NZM6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKD2L2Q9NZM6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PKD2L2Q9NZM6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKD2L2Q9NZM6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKD2L2Q9NZM6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKD2L2Q9NZM6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKD2L2Q9NZM6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PKD2L2Q9NZM6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PKD2L2Q9NZM6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKD2L2Q9NZM6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PKD2L2Q9NZM6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PKD2L2Q9NZM6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PKD2L2Q9NZM6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKD2L2Q9NZM6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKD2L2Q9NZM6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PKD2L2Q9NZM6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKD2L2Q9NZM6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKD2L2Q9NZM6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKD2L2Q9NZM6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKD2L2Q9NZM6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKD2L2Q9NZM6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PKD2L2Q9NZM6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2L2Q9NZM6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2L2Q9NZM6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PKD2L2Q9NZM6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2L2Q9NZM6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2L2Q9NZM6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2L2Q9NZM6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2L2Q9NZM6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PKD2L2Q9NZM6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKD2L2Q9NZM6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKD2L2Q9NZM6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PKD2L2Q9NZM6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2L2Q9NZM6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PKD2L2Q9NZM6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2L2Q9NZM6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2L2Q9NZM6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2L2Q9NZM6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2L2Q9NZM6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2L2Q9NZM6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PKD2L2Q9NZM6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKD2L2Q9NZM6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKD2L2Q9NZM6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PKD2L2Q9NZM6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKD2L2Q9NZM6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKD2L2Q9NZM6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKD2L2Q9NZM6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKD2L2Q9NZM6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKD2L2Q9NZM6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKD2L2Q9NZM6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKD2L2Q9NZM6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKD2L2Q9NZM6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKD2L2Q9NZM6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2L2Q9NZM6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKD2L2Q9NZM6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2L2Q9NZM6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD2L2Q9NZM6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD2L2Q9NZM6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD2L2Q9NZM6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD2L2Q9NZM6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD2L2Q9NZM6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD2L2Q9NZM6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2L2Q9NZM6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD2L2Q9NZM6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms