Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SACSQ9NZJ4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SACSQ9NZJ4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SACSQ9NZJ4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SACSQ9NZJ4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SACSQ9NZJ4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SACSQ9NZJ4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SACSQ9NZJ4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SACSQ9NZJ4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SACSQ9NZJ4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SACSQ9NZJ4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SACSQ9NZJ4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SACSQ9NZJ4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SACSQ9NZJ4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SACSQ9NZJ4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SACSQ9NZJ4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SACSQ9NZJ4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SACSQ9NZJ4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SACSQ9NZJ4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SACSQ9NZJ4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SACSQ9NZJ4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SACSQ9NZJ4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SACSQ9NZJ4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SACSQ9NZJ4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SACSQ9NZJ4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SACSQ9NZJ4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SACSQ9NZJ4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SACSQ9NZJ4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SACSQ9NZJ4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SACSQ9NZJ4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SACSQ9NZJ4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SACSQ9NZJ4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SACSQ9NZJ4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SACSQ9NZJ4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SACSQ9NZJ4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SACSQ9NZJ4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SACSQ9NZJ4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SACSQ9NZJ4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SACSQ9NZJ4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SACSQ9NZJ4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SACSQ9NZJ4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SACSQ9NZJ4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SACSQ9NZJ4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SACSQ9NZJ4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SACSQ9NZJ4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SACSQ9NZJ4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SACSQ9NZJ4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SACSQ9NZJ4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SACSQ9NZJ4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SACSQ9NZJ4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SACSQ9NZJ4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SACSQ9NZJ4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SACSQ9NZJ4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SACSQ9NZJ4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SACSQ9NZJ4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SACSQ9NZJ4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SACSQ9NZJ4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SACSQ9NZJ4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SACSQ9NZJ4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SACSQ9NZJ4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SACSQ9NZJ4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SACSQ9NZJ4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SACSQ9NZJ4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SACSQ9NZJ4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SACSQ9NZJ4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SACSQ9NZJ4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SACSQ9NZJ4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SACSQ9NZJ4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SACSQ9NZJ4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SACSQ9NZJ4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SACSQ9NZJ4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SACSQ9NZJ4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SACSQ9NZJ4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SACSQ9NZJ4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SACSQ9NZJ4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SACSQ9NZJ4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SACSQ9NZJ4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SACSQ9NZJ4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SACSQ9NZJ4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SACSQ9NZJ4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SACSQ9NZJ4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SACSQ9NZJ4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SACSQ9NZJ4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SACSQ9NZJ4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SACSQ9NZJ4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SACSQ9NZJ4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SACSQ9NZJ4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SACSQ9NZJ4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SACSQ9NZJ4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SACSQ9NZJ4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SACSQ9NZJ4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SACSQ9NZJ4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SACSQ9NZJ4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SACSQ9NZJ4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SACSQ9NZJ4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SACSQ9NZJ4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SACSQ9NZJ4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SACSQ9NZJ4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SACSQ9NZJ4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SACSQ9NZJ4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms