Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC2

TREM2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM2Q9NZC2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TREM2Q9NZC2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREM2Q9NZC2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREM2Q9NZC2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREM2Q9NZC2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TREM2Q9NZC2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TREM2Q9NZC2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TREM2Q9NZC2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREM2Q9NZC2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREM2Q9NZC2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TREM2Q9NZC2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TREM2Q9NZC2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TREM2Q9NZC2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TREM2Q9NZC2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TREM2Q9NZC2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TREM2Q9NZC2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREM2Q9NZC2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREM2Q9NZC2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREM2Q9NZC2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREM2Q9NZC2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREM2Q9NZC2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TREM2Q9NZC2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TREM2Q9NZC2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TREM2Q9NZC2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TREM2Q9NZC2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TREM2Q9NZC2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TREM2Q9NZC2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TREM2Q9NZC2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TREM2Q9NZC2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TREM2Q9NZC2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TREM2Q9NZC2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TREM2Q9NZC2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TREM2Q9NZC2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREM2Q9NZC2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREM2Q9NZC2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREM2Q9NZC2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TREM2Q9NZC2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREM2Q9NZC2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREM2Q9NZC2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREM2Q9NZC2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREM2Q9NZC2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TREM2Q9NZC2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREM2Q9NZC2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREM2Q9NZC2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TREM2Q9NZC2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREM2Q9NZC2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREM2Q9NZC2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREM2Q9NZC2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TREM2Q9NZC2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TREM2Q9NZC2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TREM2Q9NZC2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TREM2Q9NZC2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TREM2Q9NZC2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TREM2Q9NZC2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TREM2Q9NZC2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TREM2Q9NZC2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TREM2Q9NZC2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREM2Q9NZC2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREM2Q9NZC2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREM2Q9NZC2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREM2Q9NZC2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TREM2Q9NZC2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREM2Q9NZC2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREM2Q9NZC2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREM2Q9NZC2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TREM2Q9NZC2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREM2Q9NZC2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREM2Q9NZC2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TREM2Q9NZC2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREM2Q9NZC2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREM2Q9NZC2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREM2Q9NZC2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREM2Q9NZC2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TREM2Q9NZC2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TREM2Q9NZC2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREM2Q9NZC2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREM2Q9NZC2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREM2Q9NZC2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TREM2Q9NZC2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TREM2Q9NZC2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREM2Q9NZC2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TREM2Q9NZC2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREM2Q9NZC2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREM2Q9NZC2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TREM2Q9NZC2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREM2Q9NZC2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREM2Q9NZC2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TREM2Q9NZC2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREM2Q9NZC2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREM2Q9NZC2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREM2Q9NZC2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TREM2Q9NZC2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TREM2Q9NZC2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TREM2Q9NZC2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TREM2Q9NZC2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TREM2Q9NZC2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TREM2Q9NZC2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TREM2Q9NZC2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TREM2Q9NZC2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TREM2Q9NZC2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms