Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB20Q9NX57 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB20Q9NX57 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB20Q9NX57 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB20Q9NX57 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB20Q9NX57 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB20Q9NX57 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB20Q9NX57 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB20Q9NX57 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB20Q9NX57 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB20Q9NX57 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB20Q9NX57 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB20Q9NX57 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB20Q9NX57 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB20Q9NX57 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB20Q9NX57 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RAB20Q9NX57 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB20Q9NX57 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB20Q9NX57 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAB20Q9NX57 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB20Q9NX57 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB20Q9NX57 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAB20Q9NX57 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RAB20Q9NX57 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAB20Q9NX57 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAB20Q9NX57 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB20Q9NX57 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB20Q9NX57 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB20Q9NX57 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAB20Q9NX57 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB20Q9NX57 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB20Q9NX57 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAB20Q9NX57 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB20Q9NX57 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB20Q9NX57 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB20Q9NX57 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAB20Q9NX57 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB20Q9NX57 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAB20Q9NX57 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAB20Q9NX57 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAB20Q9NX57 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAB20Q9NX57 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB20Q9NX57 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB20Q9NX57 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAB20Q9NX57 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB20Q9NX57 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB20Q9NX57 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB20Q9NX57 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAB20Q9NX57 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB20Q9NX57 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB20Q9NX57 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB20Q9NX57 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB20Q9NX57 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAB20Q9NX57 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAB20Q9NX57 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RAB20Q9NX57 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB20Q9NX57 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAB20Q9NX57 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAB20Q9NX57 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB20Q9NX57 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB20Q9NX57 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB20Q9NX57 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAB20Q9NX57 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB20Q9NX57 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB20Q9NX57 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB20Q9NX57 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB20Q9NX57 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAB20Q9NX57 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB20Q9NX57 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAB20Q9NX57 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB20Q9NX57 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB20Q9NX57 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB20Q9NX57 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB20Q9NX57 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAB20Q9NX57 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB20Q9NX57 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB20Q9NX57 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB20Q9NX57 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB20Q9NX57 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB20Q9NX57 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB20Q9NX57 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB20Q9NX57 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB20Q9NX57 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB20Q9NX57 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB20Q9NX57 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB20Q9NX57 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB20Q9NX57 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB20Q9NX57 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAB20Q9NX57 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB20Q9NX57 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB20Q9NX57 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB20Q9NX57 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB20Q9NX57 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB20Q9NX57 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB20Q9NX57 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB20Q9NX57 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB20Q9NX57 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB20Q9NX57 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB20Q9NX57 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB20Q9NX57 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms