Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX18Q9NVP1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX18Q9NVP1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX18Q9NVP1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX18Q9NVP1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX18Q9NVP1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX18Q9NVP1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX18Q9NVP1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX18Q9NVP1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX18Q9NVP1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX18Q9NVP1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX18Q9NVP1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX18Q9NVP1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DDX18Q9NVP1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX18Q9NVP1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DDX18Q9NVP1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX18Q9NVP1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DDX18Q9NVP1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX18Q9NVP1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DDX18Q9NVP1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX18Q9NVP1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX18Q9NVP1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DDX18Q9NVP1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX18Q9NVP1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX18Q9NVP1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX18Q9NVP1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX18Q9NVP1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX18Q9NVP1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX18Q9NVP1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX18Q9NVP1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX18Q9NVP1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX18Q9NVP1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX18Q9NVP1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX18Q9NVP1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX18Q9NVP1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX18Q9NVP1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX18Q9NVP1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX18Q9NVP1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX18Q9NVP1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX18Q9NVP1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX18Q9NVP1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX18Q9NVP1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX18Q9NVP1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX18Q9NVP1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX18Q9NVP1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX18Q9NVP1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX18Q9NVP1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX18Q9NVP1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX18Q9NVP1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX18Q9NVP1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX18Q9NVP1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX18Q9NVP1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX18Q9NVP1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX18Q9NVP1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX18Q9NVP1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX18Q9NVP1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX18Q9NVP1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX18Q9NVP1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX18Q9NVP1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX18Q9NVP1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX18Q9NVP1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX18Q9NVP1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX18Q9NVP1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX18Q9NVP1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX18Q9NVP1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX18Q9NVP1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX18Q9NVP1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX18Q9NVP1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX18Q9NVP1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX18Q9NVP1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX18Q9NVP1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX18Q9NVP1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms