Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SMC4Q9NTJ3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
SMC4Q9NTJ3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SMC4Q9NTJ3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SMC4Q9NTJ3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SMC4Q9NTJ3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SMC4Q9NTJ3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SMC4Q9NTJ3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
SMC4Q9NTJ3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMC4Q9NTJ3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMC4Q9NTJ3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SMC4Q9NTJ3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SMC4Q9NTJ3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SMC4Q9NTJ3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SMC4Q9NTJ3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SMC4Q9NTJ3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SMC4Q9NTJ3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SMC4Q9NTJ3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SMC4Q9NTJ3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SMC4Q9NTJ3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SMC4Q9NTJ3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMC4Q9NTJ3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMC4Q9NTJ3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMC4Q9NTJ3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMC4Q9NTJ3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SMC4Q9NTJ3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMC4Q9NTJ3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMC4Q9NTJ3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SMC4Q9NTJ3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
SMC4Q9NTJ3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
SMC4Q9NTJ3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SMC4Q9NTJ3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SMC4Q9NTJ3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SMC4Q9NTJ3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMC4Q9NTJ3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SMC4Q9NTJ3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SMC4Q9NTJ3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SMC4Q9NTJ3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SMC4Q9NTJ3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMC4Q9NTJ3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SMC4Q9NTJ3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SMC4Q9NTJ3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMC4Q9NTJ3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMC4Q9NTJ3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SMC4Q9NTJ3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMC4Q9NTJ3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMC4Q9NTJ3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMC4Q9NTJ3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMC4Q9NTJ3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SMC4Q9NTJ3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SMC4Q9NTJ3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMC4Q9NTJ3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SMC4Q9NTJ3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
SMC4Q9NTJ3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SMC4Q9NTJ3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SMC4Q9NTJ3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SMC4Q9NTJ3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SMC4Q9NTJ3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMC4Q9NTJ3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
SMC4Q9NTJ3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SMC4Q9NTJ3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMC4Q9NTJ3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMC4Q9NTJ3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SMC4Q9NTJ3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SMC4Q9NTJ3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMC4Q9NTJ3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMC4Q9NTJ3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMC4Q9NTJ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMC4Q9NTJ3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SMC4Q9NTJ3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMC4Q9NTJ3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMC4Q9NTJ3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SMC4Q9NTJ3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
SMC4Q9NTJ3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMC4Q9NTJ3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMC4Q9NTJ3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMC4Q9NTJ3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMC4Q9NTJ3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMC4Q9NTJ3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SMC4Q9NTJ3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
SMC4Q9NTJ3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMC4Q9NTJ3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SMC4Q9NTJ3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SMC4Q9NTJ3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMC4Q9NTJ3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
SMC4Q9NTJ3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SMC4Q9NTJ3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
SMC4Q9NTJ3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMC4Q9NTJ3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMC4Q9NTJ3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMC4Q9NTJ3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMC4Q9NTJ3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMC4Q9NTJ3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMC4Q9NTJ3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMC4Q9NTJ3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMC4Q9NTJ3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMC4Q9NTJ3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
SMC4Q9NTJ3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMC4Q9NTJ3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMC4Q9NTJ3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms