Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC6

SPTBN5, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN5Q9NRC6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPTBN5Q9NRC6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPTBN5Q9NRC6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPTBN5Q9NRC6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPTBN5Q9NRC6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPTBN5Q9NRC6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SPTBN5Q9NRC6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPTBN5Q9NRC6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPTBN5Q9NRC6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPTBN5Q9NRC6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPTBN5Q9NRC6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPTBN5Q9NRC6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPTBN5Q9NRC6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPTBN5Q9NRC6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPTBN5Q9NRC6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SPTBN5Q9NRC6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPTBN5Q9NRC6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SPTBN5Q9NRC6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPTBN5Q9NRC6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPTBN5Q9NRC6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPTBN5Q9NRC6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SPTBN5Q9NRC6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SPTBN5Q9NRC6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPTBN5Q9NRC6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPTBN5Q9NRC6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPTBN5Q9NRC6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPTBN5Q9NRC6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SPTBN5Q9NRC6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPTBN5Q9NRC6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPTBN5Q9NRC6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPTBN5Q9NRC6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPTBN5Q9NRC6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPTBN5Q9NRC6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPTBN5Q9NRC6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPTBN5Q9NRC6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPTBN5Q9NRC6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPTBN5Q9NRC6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPTBN5Q9NRC6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPTBN5Q9NRC6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPTBN5Q9NRC6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SPTBN5Q9NRC6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPTBN5Q9NRC6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPTBN5Q9NRC6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPTBN5Q9NRC6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPTBN5Q9NRC6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPTBN5Q9NRC6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SPTBN5Q9NRC6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SPTBN5Q9NRC6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SPTBN5Q9NRC6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPTBN5Q9NRC6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPTBN5Q9NRC6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPTBN5Q9NRC6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPTBN5Q9NRC6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SPTBN5Q9NRC6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SPTBN5Q9NRC6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPTBN5Q9NRC6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SPTBN5Q9NRC6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPTBN5Q9NRC6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPTBN5Q9NRC6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPTBN5Q9NRC6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPTBN5Q9NRC6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPTBN5Q9NRC6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPTBN5Q9NRC6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPTBN5Q9NRC6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPTBN5Q9NRC6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPTBN5Q9NRC6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPTBN5Q9NRC6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPTBN5Q9NRC6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPTBN5Q9NRC6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPTBN5Q9NRC6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPTBN5Q9NRC6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPTBN5Q9NRC6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPTBN5Q9NRC6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPTBN5Q9NRC6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPTBN5Q9NRC6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPTBN5Q9NRC6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPTBN5Q9NRC6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPTBN5Q9NRC6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPTBN5Q9NRC6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPTBN5Q9NRC6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPTBN5Q9NRC6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
SPTBN5Q9NRC6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPTBN5Q9NRC6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SPTBN5Q9NRC6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SPTBN5Q9NRC6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SPTBN5Q9NRC6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPTBN5Q9NRC6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SPTBN5Q9NRC6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPTBN5Q9NRC6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SPTBN5Q9NRC6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPTBN5Q9NRC6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPTBN5Q9NRC6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SPTBN5Q9NRC6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SPTBN5Q9NRC6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SPTBN5Q9NRC6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPTBN5Q9NRC6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SPTBN5Q9NRC6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SPTBN5Q9NRC6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SPTBN5Q9NRC6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPTBN5Q9NRC6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms