Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCFQ9NPI8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FANCFQ9NPI8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FANCFQ9NPI8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCFQ9NPI8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCFQ9NPI8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCFQ9NPI8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCFQ9NPI8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCFQ9NPI8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCFQ9NPI8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCFQ9NPI8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCFQ9NPI8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCFQ9NPI8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCFQ9NPI8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCFQ9NPI8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCFQ9NPI8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCFQ9NPI8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCFQ9NPI8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCFQ9NPI8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCFQ9NPI8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCFQ9NPI8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCFQ9NPI8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCFQ9NPI8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCFQ9NPI8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCFQ9NPI8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCFQ9NPI8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCFQ9NPI8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCFQ9NPI8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCFQ9NPI8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCFQ9NPI8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FANCFQ9NPI8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FANCFQ9NPI8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FANCFQ9NPI8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FANCFQ9NPI8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCFQ9NPI8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCFQ9NPI8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCFQ9NPI8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCFQ9NPI8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCFQ9NPI8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCFQ9NPI8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCFQ9NPI8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FANCFQ9NPI8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCFQ9NPI8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FANCFQ9NPI8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCFQ9NPI8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FANCFQ9NPI8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FANCFQ9NPI8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FANCFQ9NPI8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCFQ9NPI8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCFQ9NPI8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCFQ9NPI8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCFQ9NPI8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FANCFQ9NPI8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FANCFQ9NPI8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCFQ9NPI8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCFQ9NPI8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCFQ9NPI8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCFQ9NPI8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCFQ9NPI8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCFQ9NPI8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FANCFQ9NPI8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCFQ9NPI8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCFQ9NPI8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCFQ9NPI8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCFQ9NPI8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FANCFQ9NPI8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCFQ9NPI8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FANCFQ9NPI8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCFQ9NPI8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCFQ9NPI8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCFQ9NPI8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FANCFQ9NPI8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCFQ9NPI8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FANCFQ9NPI8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCFQ9NPI8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCFQ9NPI8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCFQ9NPI8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCFQ9NPI8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCFQ9NPI8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FANCFQ9NPI8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCFQ9NPI8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCFQ9NPI8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCFQ9NPI8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCFQ9NPI8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCFQ9NPI8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FANCFQ9NPI8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCFQ9NPI8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FANCFQ9NPI8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCFQ9NPI8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCFQ9NPI8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCFQ9NPI8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FANCFQ9NPI8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCFQ9NPI8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCFQ9NPI8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCFQ9NPI8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCFQ9NPI8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FANCFQ9NPI8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCFQ9NPI8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCFQ9NPI8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FANCFQ9NPI8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms