Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APOBEC3GQ9HC16 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
APOBEC3GQ9HC16 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
APOBEC3GQ9HC16 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
APOBEC3GQ9HC16 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
APOBEC3GQ9HC16 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
APOBEC3GQ9HC16 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
APOBEC3GQ9HC16 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
APOBEC3GQ9HC16 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
APOBEC3GQ9HC16 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APOBEC3GQ9HC16 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
APOBEC3GQ9HC16 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
APOBEC3GQ9HC16 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
APOBEC3GQ9HC16 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
APOBEC3GQ9HC16 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
APOBEC3GQ9HC16 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
APOBEC3GQ9HC16 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
APOBEC3GQ9HC16 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
APOBEC3GQ9HC16 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
APOBEC3GQ9HC16 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APOBEC3GQ9HC16 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APOBEC3GQ9HC16 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
APOBEC3GQ9HC16 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
APOBEC3GQ9HC16 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOBEC3GQ9HC16 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOBEC3GQ9HC16 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOBEC3GQ9HC16 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOBEC3GQ9HC16 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOBEC3GQ9HC16 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APOBEC3GQ9HC16 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
APOBEC3GQ9HC16 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOBEC3GQ9HC16 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOBEC3GQ9HC16 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOBEC3GQ9HC16 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
APOBEC3GQ9HC16 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
APOBEC3GQ9HC16 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APOBEC3GQ9HC16 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APOBEC3GQ9HC16 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
APOBEC3GQ9HC16 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APOBEC3GQ9HC16 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
APOBEC3GQ9HC16 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
APOBEC3GQ9HC16 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
APOBEC3GQ9HC16 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APOBEC3GQ9HC16 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
APOBEC3GQ9HC16 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
APOBEC3GQ9HC16 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APOBEC3GQ9HC16 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
APOBEC3GQ9HC16 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOBEC3GQ9HC16 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
APOBEC3GQ9HC16 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
APOBEC3GQ9HC16 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
APOBEC3GQ9HC16 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOBEC3GQ9HC16 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOBEC3GQ9HC16 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOBEC3GQ9HC16 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
APOBEC3GQ9HC16 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
APOBEC3GQ9HC16 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
APOBEC3GQ9HC16 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
APOBEC3GQ9HC16 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
APOBEC3GQ9HC16 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
APOBEC3GQ9HC16 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
APOBEC3GQ9HC16 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOBEC3GQ9HC16 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOBEC3GQ9HC16 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOBEC3GQ9HC16 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOBEC3GQ9HC16 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOBEC3GQ9HC16 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
APOBEC3GQ9HC16 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms