Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SENP3Q9H4L4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SENP3Q9H4L4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SENP3Q9H4L4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SENP3Q9H4L4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SENP3Q9H4L4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SENP3Q9H4L4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SENP3Q9H4L4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SENP3Q9H4L4 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SENP3Q9H4L4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SENP3Q9H4L4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SENP3Q9H4L4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
SENP3Q9H4L4 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
SENP3Q9H4L4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
SENP3Q9H4L4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
SENP3Q9H4L4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
SENP3Q9H4L4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
SENP3Q9H4L4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SENP3Q9H4L4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SENP3Q9H4L4 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SENP3Q9H4L4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SENP3Q9H4L4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SENP3Q9H4L4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SENP3Q9H4L4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SENP3Q9H4L4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SENP3Q9H4L4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
SENP3Q9H4L4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
SENP3Q9H4L4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SENP3Q9H4L4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SENP3Q9H4L4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SENP3Q9H4L4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
SENP3Q9H4L4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
SENP3Q9H4L4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
SENP3Q9H4L4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
SENP3Q9H4L4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
SENP3Q9H4L4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
SENP3Q9H4L4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
SENP3Q9H4L4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
SENP3Q9H4L4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
SENP3Q9H4L4 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
SENP3Q9H4L4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
SENP3Q9H4L4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SENP3Q9H4L4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SENP3Q9H4L4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SENP3Q9H4L4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SENP3Q9H4L4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
SENP3Q9H4L4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SENP3Q9H4L4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SENP3Q9H4L4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SENP3Q9H4L4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SENP3Q9H4L4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SENP3Q9H4L4 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SENP3Q9H4L4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SENP3Q9H4L4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SENP3Q9H4L4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SENP3Q9H4L4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
SENP3Q9H4L4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SENP3Q9H4L4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
SENP3Q9H4L4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
SENP3Q9H4L4 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
SENP3Q9H4L4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
SENP3Q9H4L4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
SENP3Q9H4L4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
SENP3Q9H4L4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
SENP3Q9H4L4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
SENP3Q9H4L4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SENP3Q9H4L4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SENP3Q9H4L4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
SENP3Q9H4L4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SENP3Q9H4L4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
SENP3Q9H4L4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SENP3Q9H4L4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SENP3Q9H4L4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SENP3Q9H4L4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
SENP3Q9H4L4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
SENP3Q9H4L4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
SENP3Q9H4L4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
SENP3Q9H4L4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SENP3Q9H4L4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SENP3Q9H4L4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SENP3Q9H4L4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SENP3Q9H4L4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
SENP3Q9H4L4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SENP3Q9H4L4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SENP3Q9H4L4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SENP3Q9H4L4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SENP3Q9H4L4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SENP3Q9H4L4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SENP3Q9H4L4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SENP3Q9H4L4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SENP3Q9H4L4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SENP3Q9H4L4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SENP3Q9H4L4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SENP3Q9H4L4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SENP3Q9H4L4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SENP3Q9H4L4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SENP3Q9H4L4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SENP3Q9H4L4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SENP3Q9H4L4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SENP3Q9H4L4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.6 ms