Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB11FIP5Q9BXF6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB11FIP5Q9BXF6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB11FIP5Q9BXF6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB11FIP5Q9BXF6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAB11FIP5Q9BXF6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB11FIP5Q9BXF6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB11FIP5Q9BXF6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB11FIP5Q9BXF6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB11FIP5Q9BXF6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB11FIP5Q9BXF6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB11FIP5Q9BXF6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB11FIP5Q9BXF6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB11FIP5Q9BXF6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB11FIP5Q9BXF6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP5Q9BXF6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP5Q9BXF6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP5Q9BXF6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP5Q9BXF6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP5Q9BXF6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP5Q9BXF6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP5Q9BXF6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB11FIP5Q9BXF6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP5Q9BXF6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP5Q9BXF6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP5Q9BXF6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB11FIP5Q9BXF6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP5Q9BXF6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP5Q9BXF6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP5Q9BXF6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP5Q9BXF6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB11FIP5Q9BXF6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP5Q9BXF6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP5Q9BXF6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP5Q9BXF6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB11FIP5Q9BXF6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB11FIP5Q9BXF6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB11FIP5Q9BXF6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB11FIP5Q9BXF6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB11FIP5Q9BXF6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB11FIP5Q9BXF6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB11FIP5Q9BXF6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP5Q9BXF6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP5Q9BXF6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP5Q9BXF6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP5Q9BXF6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP5Q9BXF6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB11FIP5Q9BXF6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB11FIP5Q9BXF6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB11FIP5Q9BXF6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB11FIP5Q9BXF6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB11FIP5Q9BXF6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB11FIP5Q9BXF6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP5Q9BXF6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP5Q9BXF6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP5Q9BXF6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP5Q9BXF6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP5Q9BXF6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP5Q9BXF6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB11FIP5Q9BXF6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11FIP5Q9BXF6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP5Q9BXF6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP5Q9BXF6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP5Q9BXF6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP5Q9BXF6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP5Q9BXF6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP5Q9BXF6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP5Q9BXF6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP5Q9BXF6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP5Q9BXF6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP5Q9BXF6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP5Q9BXF6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP5Q9BXF6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP5Q9BXF6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP5Q9BXF6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms