Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM7Q9BQ49 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM7Q9BQ49 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM7Q9BQ49 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM7Q9BQ49 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM7Q9BQ49 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SMIM7Q9BQ49 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM7Q9BQ49 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM7Q9BQ49 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM7Q9BQ49 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM7Q9BQ49 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM7Q9BQ49 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM7Q9BQ49 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM7Q9BQ49 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM7Q9BQ49 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM7Q9BQ49 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM7Q9BQ49 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM7Q9BQ49 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM7Q9BQ49 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM7Q9BQ49 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM7Q9BQ49 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM7Q9BQ49 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM7Q9BQ49 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM7Q9BQ49 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM7Q9BQ49 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM7Q9BQ49 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM7Q9BQ49 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM7Q9BQ49 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM7Q9BQ49 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM7Q9BQ49 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM7Q9BQ49 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM7Q9BQ49 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM7Q9BQ49 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM7Q9BQ49 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM7Q9BQ49 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM7Q9BQ49 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM7Q9BQ49 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM7Q9BQ49 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM7Q9BQ49 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM7Q9BQ49 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM7Q9BQ49 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM7Q9BQ49 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM7Q9BQ49 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM7Q9BQ49 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM7Q9BQ49 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM7Q9BQ49 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM7Q9BQ49 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM7Q9BQ49 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM7Q9BQ49 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM7Q9BQ49 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM7Q9BQ49 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM7Q9BQ49 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM7Q9BQ49 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM7Q9BQ49 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms