Protein–RNA interactions for Protein: Q99576

TSC22D3, TSC22 domain family protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D3Q99576 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSC22D3Q99576 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSC22D3Q99576 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC22D3Q99576 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC22D3Q99576 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSC22D3Q99576 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TSC22D3Q99576 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSC22D3Q99576 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSC22D3Q99576 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSC22D3Q99576 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSC22D3Q99576 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC22D3Q99576 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC22D3Q99576 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC22D3Q99576 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSC22D3Q99576 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSC22D3Q99576 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSC22D3Q99576 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSC22D3Q99576 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSC22D3Q99576 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSC22D3Q99576 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSC22D3Q99576 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSC22D3Q99576 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSC22D3Q99576 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSC22D3Q99576 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSC22D3Q99576 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSC22D3Q99576 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSC22D3Q99576 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC22D3Q99576 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC22D3Q99576 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC22D3Q99576 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSC22D3Q99576 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSC22D3Q99576 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSC22D3Q99576 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSC22D3Q99576 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSC22D3Q99576 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSC22D3Q99576 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSC22D3Q99576 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSC22D3Q99576 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSC22D3Q99576 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSC22D3Q99576 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSC22D3Q99576 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC22D3Q99576 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC22D3Q99576 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC22D3Q99576 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC22D3Q99576 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSC22D3Q99576 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSC22D3Q99576 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSC22D3Q99576 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSC22D3Q99576 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSC22D3Q99576 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSC22D3Q99576 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSC22D3Q99576 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSC22D3Q99576 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSC22D3Q99576 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSC22D3Q99576 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSC22D3Q99576 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSC22D3Q99576 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSC22D3Q99576 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSC22D3Q99576 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSC22D3Q99576 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSC22D3Q99576 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC22D3Q99576 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC22D3Q99576 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC22D3Q99576 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC22D3Q99576 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC22D3Q99576 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSC22D3Q99576 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSC22D3Q99576 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSC22D3Q99576 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TSC22D3Q99576 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSC22D3Q99576 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSC22D3Q99576 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSC22D3Q99576 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSC22D3Q99576 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSC22D3Q99576 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSC22D3Q99576 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSC22D3Q99576 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSC22D3Q99576 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSC22D3Q99576 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSC22D3Q99576 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSC22D3Q99576 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSC22D3Q99576 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSC22D3Q99576 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSC22D3Q99576 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSC22D3Q99576 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSC22D3Q99576 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSC22D3Q99576 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSC22D3Q99576 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSC22D3Q99576 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSC22D3Q99576 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSC22D3Q99576 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSC22D3Q99576 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSC22D3Q99576 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSC22D3Q99576 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSC22D3Q99576 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSC22D3Q99576 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSC22D3Q99576 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSC22D3Q99576 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSC22D3Q99576 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSC22D3Q99576 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms