Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKP4Q99569 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKP4Q99569 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKP4Q99569 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKP4Q99569 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP4Q99569 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP4Q99569 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP4Q99569 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKP4Q99569 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKP4Q99569 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKP4Q99569 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKP4Q99569 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKP4Q99569 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKP4Q99569 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKP4Q99569 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKP4Q99569 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKP4Q99569 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP4Q99569 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP4Q99569 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP4Q99569 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP4Q99569 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP4Q99569 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP4Q99569 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP4Q99569 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKP4Q99569 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKP4Q99569 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKP4Q99569 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKP4Q99569 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKP4Q99569 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKP4Q99569 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKP4Q99569 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKP4Q99569 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKP4Q99569 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKP4Q99569 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKP4Q99569 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKP4Q99569 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKP4Q99569 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKP4Q99569 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKP4Q99569 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKP4Q99569 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKP4Q99569 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKP4Q99569 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP4Q99569 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP4Q99569 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKP4Q99569 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKP4Q99569 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKP4Q99569 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKP4Q99569 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKP4Q99569 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKP4Q99569 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKP4Q99569 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKP4Q99569 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PKP4Q99569 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKP4Q99569 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKP4Q99569 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKP4Q99569 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKP4Q99569 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PKP4Q99569 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PKP4Q99569 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKP4Q99569 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKP4Q99569 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PKP4Q99569 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKP4Q99569 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKP4Q99569 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKP4Q99569 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKP4Q99569 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKP4Q99569 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PKP4Q99569 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms