Protein–RNA interactions for Protein: Q96T83

SLC9A7, Sodium/hydrogen exchanger 7, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A7Q96T83 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC9A7Q96T83 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC9A7Q96T83 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC9A7Q96T83 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC9A7Q96T83 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC9A7Q96T83 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC9A7Q96T83 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC9A7Q96T83 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC9A7Q96T83 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC9A7Q96T83 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SLC9A7Q96T83 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms