Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DEPDC7Q96QD5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DEPDC7Q96QD5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DEPDC7Q96QD5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DEPDC7Q96QD5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DEPDC7Q96QD5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DEPDC7Q96QD5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DEPDC7Q96QD5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DEPDC7Q96QD5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DEPDC7Q96QD5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DEPDC7Q96QD5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DEPDC7Q96QD5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DEPDC7Q96QD5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DEPDC7Q96QD5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DEPDC7Q96QD5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DEPDC7Q96QD5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DEPDC7Q96QD5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DEPDC7Q96QD5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DEPDC7Q96QD5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DEPDC7Q96QD5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DEPDC7Q96QD5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DEPDC7Q96QD5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DEPDC7Q96QD5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DEPDC7Q96QD5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEPDC7Q96QD5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEPDC7Q96QD5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEPDC7Q96QD5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEPDC7Q96QD5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEPDC7Q96QD5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEPDC7Q96QD5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DEPDC7Q96QD5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DEPDC7Q96QD5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DEPDC7Q96QD5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DEPDC7Q96QD5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEPDC7Q96QD5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DEPDC7Q96QD5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEPDC7Q96QD5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEPDC7Q96QD5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEPDC7Q96QD5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DEPDC7Q96QD5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DEPDC7Q96QD5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DEPDC7Q96QD5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DEPDC7Q96QD5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DEPDC7Q96QD5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DEPDC7Q96QD5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DEPDC7Q96QD5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEPDC7Q96QD5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEPDC7Q96QD5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEPDC7Q96QD5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEPDC7Q96QD5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DEPDC7Q96QD5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DEPDC7Q96QD5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DEPDC7Q96QD5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DEPDC7Q96QD5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DEPDC7Q96QD5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DEPDC7Q96QD5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DEPDC7Q96QD5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DEPDC7Q96QD5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DEPDC7Q96QD5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DEPDC7Q96QD5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DEPDC7Q96QD5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DEPDC7Q96QD5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DEPDC7Q96QD5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DEPDC7Q96QD5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DEPDC7Q96QD5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEPDC7Q96QD5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEPDC7Q96QD5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEPDC7Q96QD5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEPDC7Q96QD5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEPDC7Q96QD5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DEPDC7Q96QD5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DEPDC7Q96QD5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DEPDC7Q96QD5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DEPDC7Q96QD5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DEPDC7Q96QD5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DEPDC7Q96QD5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DEPDC7Q96QD5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DEPDC7Q96QD5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DEPDC7Q96QD5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DEPDC7Q96QD5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DEPDC7Q96QD5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DEPDC7Q96QD5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DEPDC7Q96QD5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DEPDC7Q96QD5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DEPDC7Q96QD5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DEPDC7Q96QD5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
DEPDC7Q96QD5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DEPDC7Q96QD5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DEPDC7Q96QD5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DEPDC7Q96QD5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DEPDC7Q96QD5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DEPDC7Q96QD5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DEPDC7Q96QD5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DEPDC7Q96QD5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DEPDC7Q96QD5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DEPDC7Q96QD5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DEPDC7Q96QD5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DEPDC7Q96QD5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DEPDC7Q96QD5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DEPDC7Q96QD5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms