Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRIM47Q96LD4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
TRIM47Q96LD4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRIM47Q96LD4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TRIM47Q96LD4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRIM47Q96LD4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRIM47Q96LD4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRIM47Q96LD4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
TRIM47Q96LD4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRIM47Q96LD4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRIM47Q96LD4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRIM47Q96LD4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRIM47Q96LD4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRIM47Q96LD4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TRIM47Q96LD4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TRIM47Q96LD4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TRIM47Q96LD4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TRIM47Q96LD4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
TRIM47Q96LD4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
TRIM47Q96LD4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRIM47Q96LD4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRIM47Q96LD4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRIM47Q96LD4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRIM47Q96LD4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRIM47Q96LD4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRIM47Q96LD4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRIM47Q96LD4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
TRIM47Q96LD4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRIM47Q96LD4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRIM47Q96LD4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TRIM47Q96LD4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRIM47Q96LD4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRIM47Q96LD4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRIM47Q96LD4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRIM47Q96LD4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
TRIM47Q96LD4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRIM47Q96LD4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRIM47Q96LD4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRIM47Q96LD4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRIM47Q96LD4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRIM47Q96LD4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRIM47Q96LD4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRIM47Q96LD4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRIM47Q96LD4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRIM47Q96LD4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRIM47Q96LD4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRIM47Q96LD4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRIM47Q96LD4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRIM47Q96LD4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRIM47Q96LD4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRIM47Q96LD4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRIM47Q96LD4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRIM47Q96LD4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRIM47Q96LD4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRIM47Q96LD4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRIM47Q96LD4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRIM47Q96LD4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRIM47Q96LD4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRIM47Q96LD4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRIM47Q96LD4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRIM47Q96LD4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRIM47Q96LD4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRIM47Q96LD4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRIM47Q96LD4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRIM47Q96LD4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRIM47Q96LD4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRIM47Q96LD4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRIM47Q96LD4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRIM47Q96LD4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRIM47Q96LD4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRIM47Q96LD4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TRIM47Q96LD4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TRIM47Q96LD4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TRIM47Q96LD4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRIM47Q96LD4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRIM47Q96LD4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRIM47Q96LD4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRIM47Q96LD4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRIM47Q96LD4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRIM47Q96LD4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRIM47Q96LD4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM47Q96LD4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM47Q96LD4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRIM47Q96LD4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRIM47Q96LD4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
TRIM47Q96LD4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRIM47Q96LD4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.41
TRIM47Q96LD4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM47Q96LD4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM47Q96LD4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM47Q96LD4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIM47Q96LD4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIM47Q96LD4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIM47Q96LD4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIM47Q96LD4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIM47Q96LD4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIM47Q96LD4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIM47Q96LD4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRIM47Q96LD4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRIM47Q96LD4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms