Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC51Q96ER9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC51Q96ER9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC51Q96ER9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCDC51Q96ER9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCDC51Q96ER9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC51Q96ER9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC51Q96ER9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC51Q96ER9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC51Q96ER9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC51Q96ER9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC51Q96ER9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC51Q96ER9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC51Q96ER9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC51Q96ER9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC51Q96ER9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC51Q96ER9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC51Q96ER9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC51Q96ER9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC51Q96ER9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC51Q96ER9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC51Q96ER9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC51Q96ER9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC51Q96ER9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC51Q96ER9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC51Q96ER9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC51Q96ER9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC51Q96ER9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC51Q96ER9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC51Q96ER9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC51Q96ER9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC51Q96ER9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC51Q96ER9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC51Q96ER9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC51Q96ER9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC51Q96ER9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC51Q96ER9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC51Q96ER9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC51Q96ER9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC51Q96ER9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC51Q96ER9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC51Q96ER9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC51Q96ER9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC51Q96ER9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC51Q96ER9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC51Q96ER9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC51Q96ER9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC51Q96ER9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC51Q96ER9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC51Q96ER9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC51Q96ER9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC51Q96ER9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC51Q96ER9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC51Q96ER9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC51Q96ER9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC51Q96ER9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC51Q96ER9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC51Q96ER9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC51Q96ER9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC51Q96ER9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC51Q96ER9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC51Q96ER9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC51Q96ER9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC51Q96ER9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC51Q96ER9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC51Q96ER9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC51Q96ER9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms