Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HERVK_113Q902F9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
HERVK_113Q902F9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HERVK_113Q902F9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
HERVK_113Q902F9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HERVK_113Q902F9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HERVK_113Q902F9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HERVK_113Q902F9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HERVK_113Q902F9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HERVK_113Q902F9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HERVK_113Q902F9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HERVK_113Q902F9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HERVK_113Q902F9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HERVK_113Q902F9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HERVK_113Q902F9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HERVK_113Q902F9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HERVK_113Q902F9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HERVK_113Q902F9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HERVK_113Q902F9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HERVK_113Q902F9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HERVK_113Q902F9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HERVK_113Q902F9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HERVK_113Q902F9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HERVK_113Q902F9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HERVK_113Q902F9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HERVK_113Q902F9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HERVK_113Q902F9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HERVK_113Q902F9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HERVK_113Q902F9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HERVK_113Q902F9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HERVK_113Q902F9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HERVK_113Q902F9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HERVK_113Q902F9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HERVK_113Q902F9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HERVK_113Q902F9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HERVK_113Q902F9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HERVK_113Q902F9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HERVK_113Q902F9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HERVK_113Q902F9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HERVK_113Q902F9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HERVK_113Q902F9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HERVK_113Q902F9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HERVK_113Q902F9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HERVK_113Q902F9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HERVK_113Q902F9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HERVK_113Q902F9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HERVK_113Q902F9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HERVK_113Q902F9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HERVK_113Q902F9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HERVK_113Q902F9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HERVK_113Q902F9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HERVK_113Q902F9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HERVK_113Q902F9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HERVK_113Q902F9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
HERVK_113Q902F9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HERVK_113Q902F9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HERVK_113Q902F9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HERVK_113Q902F9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HERVK_113Q902F9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HERVK_113Q902F9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HERVK_113Q902F9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HERVK_113Q902F9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HERVK_113Q902F9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HERVK_113Q902F9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HERVK_113Q902F9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HERVK_113Q902F9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HERVK_113Q902F9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HERVK_113Q902F9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HERVK_113Q902F9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HERVK_113Q902F9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HERVK_113Q902F9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
HERVK_113Q902F9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HERVK_113Q902F9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HERVK_113Q902F9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HERVK_113Q902F9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HERVK_113Q902F9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HERVK_113Q902F9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HERVK_113Q902F9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HERVK_113Q902F9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HERVK_113Q902F9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HERVK_113Q902F9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HERVK_113Q902F9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HERVK_113Q902F9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HERVK_113Q902F9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HERVK_113Q902F9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HERVK_113Q902F9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HERVK_113Q902F9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HERVK_113Q902F9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HERVK_113Q902F9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HERVK_113Q902F9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HERVK_113Q902F9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HERVK_113Q902F9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERVK_113Q902F9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERVK_113Q902F9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERVK_113Q902F9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERVK_113Q902F9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HERVK_113Q902F9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERVK_113Q902F9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HERVK_113Q902F9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HERVK_113Q902F9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms