Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GADD45GIP1Q8TAE8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GADD45GIP1Q8TAE8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GADD45GIP1Q8TAE8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GADD45GIP1Q8TAE8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GADD45GIP1Q8TAE8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GADD45GIP1Q8TAE8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GADD45GIP1Q8TAE8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GADD45GIP1Q8TAE8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GADD45GIP1Q8TAE8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GADD45GIP1Q8TAE8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GADD45GIP1Q8TAE8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GADD45GIP1Q8TAE8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GADD45GIP1Q8TAE8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GADD45GIP1Q8TAE8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GADD45GIP1Q8TAE8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GADD45GIP1Q8TAE8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GADD45GIP1Q8TAE8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GADD45GIP1Q8TAE8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GADD45GIP1Q8TAE8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GADD45GIP1Q8TAE8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GADD45GIP1Q8TAE8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GADD45GIP1Q8TAE8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GADD45GIP1Q8TAE8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GADD45GIP1Q8TAE8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GADD45GIP1Q8TAE8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GADD45GIP1Q8TAE8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GADD45GIP1Q8TAE8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GADD45GIP1Q8TAE8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GADD45GIP1Q8TAE8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GADD45GIP1Q8TAE8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GADD45GIP1Q8TAE8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GADD45GIP1Q8TAE8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GADD45GIP1Q8TAE8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GADD45GIP1Q8TAE8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GADD45GIP1Q8TAE8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GADD45GIP1Q8TAE8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GADD45GIP1Q8TAE8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GADD45GIP1Q8TAE8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GADD45GIP1Q8TAE8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GADD45GIP1Q8TAE8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GADD45GIP1Q8TAE8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms