Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC82Q8N4S0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC82Q8N4S0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC82Q8N4S0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC82Q8N4S0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC82Q8N4S0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC82Q8N4S0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC82Q8N4S0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC82Q8N4S0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC82Q8N4S0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC82Q8N4S0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC82Q8N4S0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC82Q8N4S0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC82Q8N4S0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC82Q8N4S0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC82Q8N4S0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC82Q8N4S0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC82Q8N4S0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC82Q8N4S0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC82Q8N4S0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC82Q8N4S0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC82Q8N4S0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC82Q8N4S0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC82Q8N4S0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC82Q8N4S0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC82Q8N4S0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC82Q8N4S0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC82Q8N4S0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC82Q8N4S0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC82Q8N4S0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC82Q8N4S0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC82Q8N4S0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC82Q8N4S0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC82Q8N4S0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC82Q8N4S0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC82Q8N4S0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC82Q8N4S0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC82Q8N4S0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC82Q8N4S0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC82Q8N4S0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC82Q8N4S0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC82Q8N4S0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC82Q8N4S0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC82Q8N4S0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC82Q8N4S0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC82Q8N4S0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC82Q8N4S0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC82Q8N4S0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC82Q8N4S0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC82Q8N4S0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC82Q8N4S0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC82Q8N4S0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC82Q8N4S0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC82Q8N4S0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC82Q8N4S0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC82Q8N4S0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC82Q8N4S0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC82Q8N4S0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC82Q8N4S0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC82Q8N4S0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC82Q8N4S0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC82Q8N4S0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC82Q8N4S0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC82Q8N4S0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC82Q8N4S0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC82Q8N4S0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC82Q8N4S0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC82Q8N4S0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC82Q8N4S0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC82Q8N4S0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC82Q8N4S0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC82Q8N4S0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC82Q8N4S0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC82Q8N4S0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC82Q8N4S0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC82Q8N4S0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC82Q8N4S0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC82Q8N4S0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC82Q8N4S0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC82Q8N4S0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC82Q8N4S0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC82Q8N4S0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CCDC82Q8N4S0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC82Q8N4S0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC82Q8N4S0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC82Q8N4S0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC82Q8N4S0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC82Q8N4S0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC82Q8N4S0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC82Q8N4S0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC82Q8N4S0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC82Q8N4S0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC82Q8N4S0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC82Q8N4S0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC82Q8N4S0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC82Q8N4S0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC82Q8N4S0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC82Q8N4S0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC82Q8N4S0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC82Q8N4S0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms