Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUG1

KRTAP1-3, Keratin-associated protein 1-3, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-3Q8IUG1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRTAP1-3Q8IUG1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KRTAP1-3Q8IUG1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRTAP1-3Q8IUG1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KRTAP1-3Q8IUG1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRTAP1-3Q8IUG1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRTAP1-3Q8IUG1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRTAP1-3Q8IUG1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRTAP1-3Q8IUG1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRTAP1-3Q8IUG1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRTAP1-3Q8IUG1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRTAP1-3Q8IUG1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRTAP1-3Q8IUG1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRTAP1-3Q8IUG1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRTAP1-3Q8IUG1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRTAP1-3Q8IUG1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRTAP1-3Q8IUG1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRTAP1-3Q8IUG1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRTAP1-3Q8IUG1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRTAP1-3Q8IUG1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KRTAP1-3Q8IUG1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRTAP1-3Q8IUG1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRTAP1-3Q8IUG1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRTAP1-3Q8IUG1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRTAP1-3Q8IUG1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRTAP1-3Q8IUG1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRTAP1-3Q8IUG1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRTAP1-3Q8IUG1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRTAP1-3Q8IUG1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP1-3Q8IUG1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP1-3Q8IUG1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP1-3Q8IUG1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP1-3Q8IUG1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP1-3Q8IUG1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP1-3Q8IUG1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRTAP1-3Q8IUG1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRTAP1-3Q8IUG1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRTAP1-3Q8IUG1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KRTAP1-3Q8IUG1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRTAP1-3Q8IUG1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRTAP1-3Q8IUG1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRTAP1-3Q8IUG1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KRTAP1-3Q8IUG1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRTAP1-3Q8IUG1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRTAP1-3Q8IUG1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRTAP1-3Q8IUG1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRTAP1-3Q8IUG1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRTAP1-3Q8IUG1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRTAP1-3Q8IUG1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRTAP1-3Q8IUG1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRTAP1-3Q8IUG1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRTAP1-3Q8IUG1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRTAP1-3Q8IUG1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRTAP1-3Q8IUG1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRTAP1-3Q8IUG1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KRTAP1-3Q8IUG1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRTAP1-3Q8IUG1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRTAP1-3Q8IUG1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRTAP1-3Q8IUG1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRTAP1-3Q8IUG1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRTAP1-3Q8IUG1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRTAP1-3Q8IUG1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KRTAP1-3Q8IUG1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRTAP1-3Q8IUG1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRTAP1-3Q8IUG1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRTAP1-3Q8IUG1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRTAP1-3Q8IUG1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRTAP1-3Q8IUG1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRTAP1-3Q8IUG1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRTAP1-3Q8IUG1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRTAP1-3Q8IUG1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRTAP1-3Q8IUG1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRTAP1-3Q8IUG1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRTAP1-3Q8IUG1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRTAP1-3Q8IUG1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRTAP1-3Q8IUG1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRTAP1-3Q8IUG1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRTAP1-3Q8IUG1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRTAP1-3Q8IUG1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRTAP1-3Q8IUG1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRTAP1-3Q8IUG1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRTAP1-3Q8IUG1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRTAP1-3Q8IUG1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRTAP1-3Q8IUG1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRTAP1-3Q8IUG1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRTAP1-3Q8IUG1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRTAP1-3Q8IUG1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KRTAP1-3Q8IUG1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms